金魚的雄，雌鑑別並不難分。雄性金魚的胸鰭前緣特別的肥厚，粗硬，肉眼就可以看到在胸鰭的第一條鰭條線上以及鰓蓋上有交多，乳白色刺狀的小白點狀物，俗稱：“追星”。追星在水溫較低的情況下，不會出現。在繁殖季節追星特別明顯。雌性金魚並沒有追星。這是識別金魚雄，雌最為簡潔有效的方法之一。或看其生殖孔的形狀，來分辨金魚的雄，雌。雄性金魚的生殖孔，呈現菱形，而雌性金魚則是，呈現橢圓形。再者看金魚的體態分辨雄，雌。在繁殖期間，觀看金魚的體態很容易分辨出雄，雌。雄性金魚的體態均勻，而雌性金魚，因帶有魚卵原因，其腹部比較肥胖，鼓脹。珍珠金魚例外！
還可用手觸摸的方式鑑別金魚的雄，雌。在雄性金魚的的腹部從生殖孔到腹鰭之間，在中間位置有一條硬硬的小梗。觸手可摸到。而雌性金魚沒有那條硬梗。
也可用擠壓金魚腹部的方式鑑別金魚的雄，雌。不過這個方法長用於人工繁殖時，檢查親魚是否達到性成熟，可以用於繁衍後代時的檢疫。當在繁殖時期，用手輕輕擠壓金魚的腹部，雄性金魚的生殖孔會排出乳白色的精液，而雌性金魚則會排出數粒魚卵。如果沒有乳白色精液或魚卵流出，表示金魚尚未達到成熟期或已經繁衍過，需要過段時間，才能繁衍後代。
金魚鑑別以後，雄，雌金魚如何配種一般常見的金魚配種比例為，雄，雌1：1的比例來配種也可選用雄，雌魚2：1或3：1的比例來配種因為。這樣可以提高魚卵的受精率如果是人工繁殖，雄，雌比例為3：2或5：3等比例配種。
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